Junto com a subunidade Apc2, forma o eixo catalítico da
ubiquitina E3 ligase, complexo promotor de
anáfase do ciclossomo. Possui um domínio RING H2 que interage com o domínio culina da Apc2. A Apc11 também interage com as
ubiquitina E2
ligases envolvidas nas reações de
ubiquitinação de APC-C.